يتمثل الهدف أمام اللاعب في كل مرحلة في لعبة فقاعات الهامستر في الوصول إلى عدد محدد من النقاط من خلال إسقاط الفقاعات المتنوعة عن طريق الجمع بين ما لا يقل عن ثلاثة فقاعات من نفس اللون، وكلما نجح اللاعب في إسقاط عدد أكبر من الفقاعات فإن النقاط التي يحصدها تكون أكبر. ويتم التصويب من خلال مؤشر الفأرة عبر التأشير على المكان المناسب والضغط على الزر الأيسر للفأرة للاطلاق، وإذا فشل اللاعب في التصويب لعدة مرات متتالية فذلك يؤدي إلى ظهور صف علوي جديد مما يصعب المهمة اكثر. وتجدر الإشارة إلى أن أول صف لا يجب أن يصل إلى الأسفل، وإلا يخسر اللاعب محاولته.